菌群異常可以由多種原因引起，如：

　　1. 抗生素使用：抗生素不僅殺死有害菌，也同時破壞了有益菌，從而導致菌群異常。

　　2. 飲食結構改變：飲食結構改變引起的菌群異常，如吃了過多的加工食品、高糖、高脂肪、低纖維、低飽和脂肪酸等食品都有可能破壞腸道菌群平衡。

　　3. 壓力：長期的精神緊張、焦慮、壓力等也會導致腸道菌群失調。

　　4. 疾病：某些疾病或疾病治療也可能影響腸道菌群平衡，如胃腸道疾病、自身免疫性疾病等。

　　5. 生活環境改變：生活環境的改變也會影響腸道菌群平衡，如長期住在空氣污染嚴重的城市，接觸有害化學物質等。

　　6. 遺傳因素：個體不同，有些人天生就有腸道菌群平衡失調的傾向。