黃豆發酵的方式是制作豆腐或豆漿。制作豆腐時，黃豆先要浸泡過夜，然后磨成豆漿，再加熱至80度左右，加入凝固劑進行凝固。豆腐可以自行發酵，也可以在豆腐中加入乳酸菌進行發酵，這樣可以在豆腐中加入益生菌，增加營養價值。制作豆漿時，黃豆同樣需要浸泡，然后磨成豆漿，加入糖和發酵劑（如酵母或乳酸菌），放置在溫暖的地方進行發酵。發酵后的豆漿可以用于制作豆腐或豆漿酸奶等發酵食品。