慢性腸胃炎和急性腸胃炎是起病特點、病因、臨床表現都存在明顯差異的兩類消化系統疾病，二者核心區別可以從三方面清晰劃分。
1. 起病與病程不同。急性腸胃炎屬于突發疾病，大多在接觸誘因后幾小時到一天內就快速發作，病程較短，規范干預后一般3-7天就能完全康復，很少遺留長期問題；慢性腸胃炎起病隱匿，大多是長期不適逐漸加重，病程至少在2個月以上，不少患者的不適會遷延數年甚至十幾年，癥狀反復發作，難以短時間內斷根。
2. 致病原因不同。急性腸胃炎絕大多數是急性感染誘發，最常見的就是吃了被細菌、病毒污染的不潔食物、變質食物，偶爾也會因為大量吃生冷刺激食物導致急性腸胃黏膜損傷；慢性腸胃炎多是長期不良刺激累積導致，比如長期飲食不規律、嗜酒嗜辣、長期精神壓力過大，也有不少患者是急性腸胃炎治療不***，病情反復遷延發展成慢性，還有部分和免疫異常、長期腸道菌群紊亂相關。
3. 癥狀表現不同。急性腸胃炎癥狀猛烈且典型，一般會出現劇烈腹痛、頻繁上吐下瀉，不少患者會伴隨發熱、全身酸痛乏力，嚴重時還會出現脫水、電解質紊亂；慢性腸胃炎大多不會出現劇烈的急性發作癥狀，主要表現為長期的腹部隱痛、腹脹、消化不良，進食生冷、油膩、刺激食物后不適會加重，常伴隨長期大便不成形，或者腹瀉便秘交替的情況，癥狀時輕時重，反復出現。
