腸道菌群失調的癥狀以消化道不適最為常見，部分患者也會出現全身、免疫力相關的異常表現，具體如下：

　　1. 排便及消化道局部不適，這是最常見的表現，多數患者首先會出現排便習慣改變，比如長期便秘、反復腹瀉，或是便秘和腹瀉交替出現，平時經常感覺腹脹、肚子隱痛、排氣增多，吃了油膩、生冷的食物后不適會明顯加重，部分人還會伴隨消化不良、反酸噯氣，吃少量食物就有明顯的飽脹感。

　　2. 營養吸收異常，長期腸道菌群失調會破壞腸道的正常吸收功能，沒法正常吸收食物中的蛋白質、維生素、礦物質等營養，時間久了就會出現不明原因的體重下降、全身乏力、皮膚暗黃粗糙，嚴重一點還會誘發營養不良性貧血，兒童長期存在這個問題，還會拖慢生長發育速度。

　　3. 全身及其他系統異常，腸道是人體z大的免疫器官，菌群失調后免疫力會明顯下降，比普通人更容易感冒、出現過敏性鼻炎、濕疹等過敏性疾病，目前很多研究也證實，腸道菌群失調會通過腦腸軸影響情緒和睡眠，不少患者會伴隨莫名的焦慮煩躁、睡眠質量下降，部分人還會反復出現口臭、口腔潰瘍。