真菌類益生菌制劑大多需要在2-8℃的低溫避光干燥環境密封儲存，經過特殊耐溫包埋處理的常溫型制劑，可在25℃以下的陰涼環境儲存，核心要規避高溫、潮濕和光照破壞活菌活性。

　　1. 嚴格控制儲存溫度。未經過耐溫處理的普通真菌類益生菌，比如常用的布拉氏酵母菌制劑，大多需要放進冰箱冷藏室保存，維持溫度在2-8℃即可，注意不能放進冷凍層，極端低溫會凍死活菌孢子，破壞活性；如果是明確標注了可常溫保存的制劑，可以放在25℃以下的陰涼處，但夏季氣溫高的時候，或者長期存放的話，還是移進冰箱冷藏，別放在灶臺、汽車后備箱這種持續高溫的地方。

　　2. 做好密封防潮防護。真菌益生菌接觸潮氣后很容易提前激活、失活，甚至發霉變質，每次取用后必須立刻擰緊瓶蓋，獨立鋁箔包裝的要吃一袋拆一袋，不要提前拆口暴露在空氣中；儲存位置也要避開衛生間、廚房水槽邊這種高濕度區域，大開口包裝的制劑，還可以在瓶內放1包食品干燥劑后再封好，降低環境濕度影響。

　　3. 全程避開光照直射。紫外線會直接殺滅真菌類益生菌的活菌，不管是什么包裝的制劑，都不能放在窗臺、陽臺這種能被陽光直曬的位置，放在密閉的抽屜、儲物柜這種避光區域，哪怕是深色不透明包裝的制劑，也不要長期放在透光的環境里，避免活性慢慢損耗。