有些研究表明，菌群失調可能會對睡眠產生負面影響，但目前還沒有充分證據表明它直接導致失眠。菌群失調可能會影響身體內部化學信號，包括褪黑素和神經遞質，而這些信號與睡眠有關。菌群失調可能會導致身體炎癥反應，從而影響睡眠質量。但菌群失調不一定是導致失眠的唯一因素，其他因素包括心理壓力、藥物和飲食習慣等都可能對睡眠產生影響。