蛋白質包涵體（protein inclusion bodies）是細胞內一種常見的蛋白質聚集現象。它是指蛋白質聚集成的一種不可溶性的顆粒狀結構，通常出現在大量表達外源蛋白質的細胞中。蛋白質包涵體的形成可能是由于蛋白質的過度表達、折疊異常、蛋白質缺少機會正確折疊、高溫、低pH值和缺乏重金屬等環境壓力等因素導致的。蛋白質包涵體可以通過重組蛋白質水解酶的加入、低溫、添加劑、超聲波、曝氣、酸堿等方法進行溶解和處理，使其重新達到活性狀態。蛋白質包涵體具有很強的穩定性和易分離性，在生物技術中可應用于蛋白質制備、純化和表達，因此有著重要的應用前景。